Demir Kubbe hava savunma sisteminin bazı zayıf yönleri şunlardır:
Maliyet: Her interceptor roketinin maliyeti oldukça yüksektir, bu da sistemin sürdürülebilirliğini zorlayabilir. Özellikle çok sayıda roket saldırısı durumunda maliyetler hızla artar.
Hedefleme Yanlışları: Sistem, her zaman doğru hedef tespiti yapamayabilir. Yanlış analizler, gereksiz interceptor fırlatmalara yol açabilir veya bazı tehditlerin gözden kaçmasına neden olabilir.
Yüksek Hızlı ve Çoklu Saldırılar: Çok sayıda roketin aynı anda fırlatılması durumunda, sistemin müdahale kapasitesi sınırlı kalabilir. Bu tür durumlarda bazı roketler hedefe ulaşabilir.
Düşman Stratejileri: Düşman, sistemin zayıflıklarını tespit edip, yanıltıcı veya düşük irtifalı saldırılar düzenleyerek Demir Kubbe'nin etkinliğini azaltabilir.
Siyasi ve Stratejik Sınırlamalar: Sistem, yalnızca kısa menzilli tehditlere karşı etkilidir. Uzun menzilli roketlere veya diğer hava tehditlerine karşı yeterli koruma sağlamaz. Bu zayıf yönler, Demir Kubbe'nin etkinliğini sınırlayabilir, ancak yine de özellikle kısa menzilli tehditlere karşı önemli bir koruma sağlar.